biologische reductie van nitraat en nitriet tot stikstof en distikstofoxide door micro-organismen in de bodem.
De micro-organismen gebruiken bij de denitrificatie bij voorkeur zuurstof als elektronenreceptor, maar bij onvoldoende aanbod van moleculaire zuurstof (b.v. onder anaërobe omstandigheden) gebruiken zij ook de zuurstof van de nitraat en nitriet als elektronenreceptor. Denitrificatie kan worden uitgevoerd door bepaalde groepen van heterotrofe en chemo-autotrofe micro-organismen. Tot de laatste groep behoren m.n. bacteriën die in afwezigheid van zuurstof nitraat gebruiken voor de oxidatie van b.v. waterstof (Micrococcus denitrificans) of zwavel (Thiobacillus denitrificans). Denitrificatie vormt een belangrijk onderdeel van de stikstofkringloop. Het resulterende stikstofverlies door verluchtiging is ongunstig voor de stikstofbemesting bij de landbouw, maar kan een gunstig effect hebben bij nitraatverontreiniging van (grond)water, omdat daardoor de nitraatbemesting wordt verkleind.
