Geboren 25 Maart 1528 te Waiblingen in Wurtemberg, zoon van een smid. Hij studeerde van 1541—1546 te Tübingen; eerst predikant, later superintendent in Göppingen en in 1562 professor te Tübingen.
Hij had veelzijdige kennis, rijke kerkelijke ervaring, diplomatieke gaven en was alleszins geschikt om in tijden van strijd als bemiddelaar op te treden.Toen, in de jaren 1530—1574 ongeveer, de Luthersche kerk door allerhande partijen dreigde verscheurd te worden, heeft Andreae gezocht naar een weg, om tot vrede te geraken. Om zijn gemeente voor dat werk des vredes te winnen, beproefde hij in zes predicatiën haar over den stand der kwestie in te lichten (1573) en een weg tot oplossing aan te wijzen. Hij vond ongemeenen bijval en bestemde zijn predicatiën tot een basis voor verdere onderhandelingen. Omdat de beroemde Luthersche theoloog Marten Chemnitz ze, wat den vorm aanging, niet daarvoor geschikt achtte, werkte Andreae ze om tot de z. g. n. Schwäbische Concordia, maar ook deze vond geen genade in de oogen der theologen. De keurvorst van Saksen riep nu een Convent tezamen in Torgau (1576) en daar stelde Andreae met Chemnitz en andere godgeleerden het Torgausche boek op. Dit boek werd nu door Andreae, Chemnitz en vier andere godgeleerden in het klooster Bergen bij Maagdenburg nog eens omgewerkt tot het Bergsche boek of de Formula Concordiae.