tegenstrijdige werking van krachten of stoffen; verschijnsel dat organismen een ongunstige invloed op elkaar uitoefenen. Antagonisme kan het gevolg zijn van o.a. concurrentie om voedingsstoffen, waardoor voedselgebrek ontstaat, of van de vorming van stofwisselingsprodukten door micro-organismen die giftig zijn voor andere micro-organismen (antibiotica).
In de microflora in de bodem, het water en het dierlijk lichaam is antagonisme anders, zodat de ziektekiemen meestal te gronde gaan.