Aalter-Brug is een woonkern in de Belgische gemeente Aalter, gelegen in het noorden van de gemeente.
Het wordt doorsneden door het kanaal Gent-Brugge, rijksweg Aalter-Maldegem en ongeveer een halve eeuw lang door de tramlijn van Eeklo naar Tielt.
Voor de aanleg in 1959 van de drukke N44 liep het doorgaand verkeer, komende van Eeklo en Ursel, door het dorp langs de Sint-Godelievestraat.
Aan het kanaal Gent-Brugge was er al heel vroeg economische bedrijvigheid, het lag mee aan de basis van de nu bestaande bedrijvenzone(s).
In Aalter-Brug bevond zich het zogenaamde Woestijnegoed, verblijfplaats van de heren van de Woestijne die gedurende het Ancien Regime heer waren van Aalter en Knesselare.
De laatste nu nog bestaande bebouwing dateert van 1895, bij de aanleg van de gecontesteerde bedrijvenzone Woestijne zal de boerderij waarschijnlijk geïntegreerd worden.