Toen Baantjer in 1961 meedeed aan een verhalenwedstrijd van Het Parool won hij een prijs.
In de jaren erna schreef hij nog een paar boeken en begin jaren zestig bedacht Baantjer het personage De Cock dat hij op twee van zijn collega's baseerde.
Op 29 mei 2008 opende Peter Römer in Amsterdam het Appie Baantjer Museum dat in de kelder van café Heffer in de Warmoesstraat is gevestigd.
Deze locatie bevindt zich niet ver van het voormalig politiebureau waar Baantjer werkte.
Hoewel Baantjer aangaf met de De Cock-serie te stoppen en het laatste boek daarvan in oktober 2008 te zullen presenteren, maakte hij tijdens een interview door Theodor Holman in een uitzending van Het Gesprek bekend samen met Simon de Waal een boek te zullen schrijven.
In april 2010 kwam het tweede boek van het duo Baantjer en de Waal uit, getiteld Een lijk in de kast.