Vele geneesmiddelen verlaten het lichaam in de een of andere (actieve) vorm. Vaak gebeurt dit via de ontlasting of de urine.
Er is nog te weinig onderzoek verricht naar de vraag in hoeverre de omgeving wordt vervuild door geneesmiddelen. Onderzoek naar de gevolgen van de pil toonde echter een sterk verhoogd gehalte aan oestrogenen in het oppervlaktewater aan. Vele geneesmiddelen bevatten (soms zwaar) giftige verbindingen. Het is dan ook vanuit milieuhygiënisch oogpunt af te raden restanten geneesmiddelen in de vuilniszak te gooien of door de gootsteen te spoelen. Ook bewaren is onverstandig, omdat veel geneesmiddelen aan bederf onderhevig zijn; bovendien bestaat de mogelijkheid dat kinderen ze in handen krijgen. Daarom is het verstandiger restanten en oude geneesmiddelen in te leveren bij de apotheken, waarna zij worden verbrand.
