De vlaggen van de steden Leeuwarden, Franeker, Dokkum, Harlingen, Staveren, Workum en Hindeloopen, en die van de Waddeneilanden zijn het oudst gedocumenteerd (17de en 18de eeuw). Harlingen stelt officieel in 1857 als eerste Friese gemeente een vlag in; Vlieland volgt in 1938.
Vóór 1956 voeren officieel 9 gemeenten een vlag. Tussen 1956 en 1961 volgen nog eens 9 gemeenten; tussen 1961 en 1965, 25 gemeenten.
In 1963 alleen al 18. Dit n.a.v. de manifestatie Frisiana in 1963, waarbij alle 44 gemeentevlaggen werden gehesen.
De officiële bevestiging van de gemeentevlag van Rauwerderhem volgde pas in 1971 (zie Wapen).