Kleine stad, voor het eerst genoemd in 1046 en als nederzetting behorend tot de Gentse St.-Pietersabdij. Rond 1127 kreeg IJzendijke stadsrechten en later trad de stad toe tot de Vlaamse Hanze.
De dankzij de handel in wol tot bloei gekomen stad werd in 1404 door de zee verzwolgen. De Spanjaarden legden ten zuiden van het oude IJzendijke in 1587 een verschansing aan, die in 1604 door Maurits werd veroverd.
Na het ontstaan van de Mauritspolder (1614) en de Oranjepolder (1618) volgde de aanleg van een regelmatige zeshoekige vesting met in het midden een exercitieterrein (Markt). In 1648 werd de vesting IJzendijke een garnizoensstad.
In 1788 verdween de haven en in 1841-'43 werd de vesting grotendeels geslecht. Het zuidelijke deel van de stad raakte in 1944 beschadigd.
Aan die zijde is de stad na de Tweede Wereldoorlog uitgebreid.
