AFI kwam echter weer bij elkaar voor een reünie-optreden en alle leden besloot hierna toch fulltime aan de band te gaan werken.
In 1996 volgde dan Very Proud of Ya. Kresge verliet na een aantal tournees de band en werd vervangen door Hunter Burgan die na de opnamen van Shut Your Mouth and Open Your Eyes fulltime bassist werd bij de band.
De band nam met hem Black Sails in the Sunset op, een muzikaal keerpunt in de carrière van de band.
Daarnaast verzorgde The Offspring-zanger Dexter Holland ook gastvocalen op een aantal nummers van het album.
Met het album The Art of Drowning wisten ze weer naar een iets breder publiek door te breken, mede dankzij de single "The Days of the Phoenix".
Op 29 september 2009 werd het nieuwe album Crash Love uitgebracht, waarvan een gewone versie en een luxe-editie bestaat.
