In 1943 werkten ze samen aan de verbouwing en uitbreiding van de Werkplaats Kindergemeenschap van Kees Boeke in Bilthoven.
Eveneens in 1946 kreeg Nicolaï voor zijn ontwerp van een religieus centrum de zilveren medaille van de Prix de Rome.
Samen met de winnaar van de gouden medaille, Jaap Schipper, maakten Nicolaï en zijn vrouw een reis van ruim vijf maanden door Frankrijk, Italië, Spanje en Noord-Afrika.
Tot zijn werken behoren het Ontspanningscentrum De Boô in Schoonebeek, de U.T.S. Hendrick de Keyzerschool in Amsterdam, de Academie voor Kunst en Industrie te Enschede, een uitbreiding van het hoofdkantoor van de IJsselmij te Zwolle, kantoren, kerken, winkelcentra, andere scholen en een groot aantal woningen.
Na zijn pensionering legde Nicolaï zich toe op het uittypen van door zijn vrouw geschreven werk, waaronder architectuurtheoretische beschouwingen, verslagen die ze van hun vele reizen door vooral Zuid-Europa had gemaakt, sprookjes en haiku's.
Terwijl hij nog studeerde had Nicolaï op discussiebijeenkomsten van de Doornse Leergangen met de uitgangspunten van beide stromingen kennisgemaakt.
