De Aaltjemeerpolder is een droogmakerij in het westen van Friesland.
De veenpolder bij Ferwoude ontstond rond 1644 uit wat oorspronkelijk het Aaltjesmeer was.
Het vormt officieel de Fallingabuurster- en Aaltjemeerpolder, wat ook een eigen waterschap is geweest.
Het vormt tegenwoordig een gezamenlijk natuurgebied met het Workumermeer.
Het natuurgebied wordt beheerd door It Fryske Gea en zijn samen 164 hectare groot.
Het ijzerhoudend grondwater van de Aaltjemeerpolder komt in greppels en sloten aan de oppervlakte.