Het wapen van Aagtekerke bevat in zilver een gouden buste van een vrouw.
Het wapen van de heerlijkheid Aagtekerke voerde de buste in natuurlijke kleur, met een mantel van purper.
Sinds 1327 is er in Aagtekerke sprake van de kerk van Sint-Agatha.
Bijzonder is het grafmonument van Hendrik Thibaut, heer van Aagtekerke, burgemeester van Middelburg en bewindhebber van de Vereenigde Oostindische Compagnie.
De bouw had nog in 1876 plaats, Aagtekerke bleef echter een afdeling van de Middelburgse gemeente.
Tot het begin van de 14e eeuw, toen Aagtekerke een eigen kerk kreeg, maakte het dorp deel uit van de parochie Domburg.
