Na twee rustige seizoenen eindigde de club in 1925 slechts op de 22ste plaats, maar zette dit één jaar later wel recht met de tweede plaats achter Boca Juniors.
In 1934 fuseerde de club met CA Atlanta en werd zo Atlanta-Argentinos Juniors, maar na 25 speeldagen werd de fusie ongedaan gemaakt en vervolledigde Argentinos Juniors het seizoen en werd laatste.
Na negentien jaar afwezigheid voegde de club zich terug bij de elite, maar meer dan een grijze muis was de club niet de eerste jaren.
Independiente verloor van Atlanta, maar door een 4-1 draai om de oren van Racing Club zagen de jongens van Argentinos de eerste titel aan hun neus voorbij gaan en werden zelfs nog bijgebeend door River Plate.
Tegen Racing Club werden er 44 penalty's genomen en werd het uiteindelijk 20-19 in het voordeel van Argentinos.
De club eindigde in de lagere middenmoot een paar keer en omdat degradatie bepaald wordt over de resultaten van drie seizoenen degradeerde de club in 2014 uit de hoogste klasse.
