Per gebied dat tot de ecologische hoofdstructuur behoort, worden de na te streven natuurdoelen aangegeven. Nagegaan is voor welke planten- en diergemeenschappen Groningen een belangrijke provincie is.
Deze natuurdoeltypen zijn door de provincie omschreven, zoals ‘veenmoeraslandschap’ voor het deel van Midden-Groningen bij het Schildmeer. Het ministerie van Landbouw, Natuurbeheer en Visserij financiert de kosten op basis van een overeenkomst over de te realiseren doelen.
