De B-cel circuleert door het lichaam en is te vinden in lymfeknopen. De celreceptoren aan het celoppervlak her- kennen specifieke antigenen en zodra dit gebeurt, geeft de B-lymfocyt zijn antistoffen af in het bloed.
Deze antistoffen binden met de antigenen aan het oppervlak van de indringers. Daardoor worden de indringers als het ware gemarkeerd en onschadelijk gemaakt. Fagocyten kunnen de lichaamsvreemde materialen op deze manier beter herkennen en ze efficiënt opruimen.
De B-cel is een antigeen presenterende cel (APC); zodra de cel aan een antigeen is gebonden, neemt de B-cel deeltjes van het antigeen in zich op. Deze worden getoond aan T-helpercellen, die daarmee andere afweercellen aansturen.
