Dijkdorp, hoogstwaarschijnlijk genoemd naar Jacobus van Pernesse, aan wie in 1249 het gebruik van een haven werd toegestaan. In de 15de eeuw vormde zich bebouwing aan de Pastoriedijk, die samen met de Ring een cirkelvormig gebied omsluit.
In 1929 werd aan de westkant de 1ste Petroleumhaven gegraven voor de olieraffinaderij van Shell (1936). Na de annexatie van Pernis door Rotterdam in 1934 volgde de aanleg van de 2de Petroleumhaven (1938).
Sinds de aanleg van de Eemhaven (1946) aan de oostzijde is Pernis geheel door havens ingesloten. Binnen de cirkelvormige kern is in 1958 een nieuwbouwwijk verwezenlijkt.
Na het dempen van de vissershaven (Nieuwedijk) in 1959 is meer westelijk de Madroelhaven gegraven (1960).