Isomeren is de naam van scheikundige verbindingen waarvan de moleculen opgebouwd zijn uit evenveel en ook gelijke atomen (ze hebben dus een zelfde moleculegewicht), maar toch in eigenschappen verschillen. Zo verschillen alcoholen en ethers met elkaar van structuur, b.v.
CH3 CH2OH (ethanol) en CH3.0-CH3 (dimethylether). Hun verschillende eigenschappen (reuk, kookpunt, brandpunt, enz.) hangen van hun structuur af. Dit verschijnsel heet structurele isomerie. Bij optische isomerie verschilt zelfs de structuur niet, alleen de ruimtelijke opbouw van de moleculen, en wel zo, dat ze elkaars spiegelbeeld vormen; zie asymmetrisch koolstofatoom.
