Dorp ontstaan in 1439 als Pietershoek aan de monding van de tot afwatering van de Binnenbedijkte Maas dienende Boezemvliet. De bebouwing concentreerde zich bij de sluis in de Boezemvaart en bij de vissershaven, evenals langs de vaart (Schouteneinde) en de dijk (Weverseinde).
Vanaf 1650 werden in Puttershoek regionaal bekende paardenmarkten gehouden. De in 1912 aan de westzijde gevestigde suikerfabriek had te lijden van bombardementen in 1940 en 1945.
Na de Watersnoodramp van 1953 heeft men de sluis gedicht (1964) en zijn vanwege dijkverhoging veel dijkwoningen afgebroken (1964-'66). Aan de zuidkant is in 1963 een winkelcentrum ingericht en later zijn zuidelijk daarvan uitbreidingswijken verwezenlijkt.