Ned. historicus en archivaris, *22.1.1848 Amsterdam, †5.12.1922 Utrecht; zoon van Frederik Muller. In 1874 werd Muller gemeentearchivaris van Utrecht, in 1879 eveneens rijksarchivaris aldaar.
Aan het einde van Mullers loopbaan (1920) was de ordening en beschrijving van het gemeentearchief voltooid. Muller formuleerde internationaal erkende beginselen voor het inventariseren van een archief. Samen met R.J.Fruin en J.A.Feith publiceerde hij de beroemde Handleiding voor het ordenen en beschrijven van archieven (1898; 2e dr. 1920). Werken: Middeleeuwsche rechtsbronnen der stad Utrecht (4 dln. 1883–85), Het rechtsboek van de Dom (1895), Schetsen uit de middeleeuwen (2 dln. 1900–14), De Dom van Utrecht (1906), Oorkondenboek van het Sticht Utrecht (1920).
LITT. Cat. tent. Samuel Muller, Gemeentelijk Archief Utrecht (1974).