1. al die stoffen, welke in het lichaam gebracht aanleiding geven tot de vorming van tegenstoffen (zie anti-lichamen). Antigenen omvatten dus allerlei stoffen, fermenten, toxinen enz.; meestal zijn het eiwitten, soms ook polysacchariden of nog andere chemicaliën.
2. Antigeen wordt ook genoemd het reagens (zie reactie3), gebruikt bij de complement-bindingsreactie, zie aldaar.