Onderzoeksinstituten zijn instellingen waar wetenschappelijk onderzoek wordt verricht. Naast de faculteiten kennen vele universiteiten onderzoeksinstituten, waarbinnen het onderzoek of delen ervan zijn ondergebracht. Een deel van deze instituten valt binnen de grenzen van een faculteit, maar andere instituten verrichten multidisciplinair onderzoek en doorkruisen de grenzen van meerdere faculteiten.
Door het bestaan van deze instituten hebben de universiteiten in organisatorische zin het karakter van een matrixorganisatie gekregen. Omdat een deel van de bevoegdheden inzake het onderzoek van de faculteiten zijn overgegaan naar de instituten. (Wikipedia)