Verscheidene kloosters in de Nederlanden droegen dezen naam.
1) St. Agatha-klooster'te St. Agatha (zie hierboven), een monniken klooster van de Orde der Kruishceren, waarvan reeds 2 Febr.'1371 het ontstaan dagteekende, doordien Diederik van Heurne, Heer van Perwijs en Duffel, als voogd over Jan IV Heer van Cuyk in deze streek het bewind voerende, aan de Orde van het Heilige Kruis eene kapel ten geschenke gaf, in 1300 gebouwd en aan de H. Agatha gewijd. In den 80-jarigen oorlog had dit klooster veel te lijden; den 8Januarij 1644 werd het verbeurd verklaard ten voordeele van den Prins van Oranje, zoodat 14 Aug. 1648 de geestelijken er uit verdreven werden. Later kregen zij weder vergunning om het te bewonen tegen eene jaarlijksche uitkeering van 1200 gulden aan de Domeinkamer van Zijne Hoogheid, welke uitkeering naderhand op 1700 gulden is bepaald. Het kloostergebouw is vrij groot, en bezit fraaije handschriften uit de 14, 13 en 16 eeuw.
2) St. Agatha-klooster, een voormalig nonnen-klooster te Zwolle.
3) St. Agatha-klooster, een voormalig nonnen-klooster te Amersfoort, in 1399 gesticht door Rutgerus van den Doem en diens huisvrouw Belia. In 1404 gingen de geestelijke zusters van dit klooster in de Orde der Minunen; maar in 1435 namen zij den regel van St. Augustinus aan. Na de Kerkhervorming is dit klooster te niet gegaan.
4) St. Agatha's Convent, voormalig nonnen-klooster in Rijnland, buiten de Rijnsburgsche poort te Leyden,bewoond door nonnen van de Orde van St. Augustinus, werd in den 80-jarigen oorlog ornvergehaald en bij de vierde uitlegging van Leyden gedeeltelijk bij de stad getrokken.
5) Zie AAGTEN(ST.).