Onderzoek van schendingen is onderzoek naar schendingen van mensenrechten en wordt gedaan door IGO's, NGO's en wetenschappelijke instituten. Omdat onderzoeksmissies in de regel afhankelijk zijn van zekere medewerking van de autoriteiten, gaan naar verhouding veel missies naar landen die goed toegankelijk zijn.
Risico's van missies zijn o.m. dat geïnterviewde personen te duchten hebben voor represailles, dat de overheid belangrijke feiten weet te verhullen, dat het verslag soms gebaseerd is op oppervlakkige indrukken of dat de overheid de missie gebruikt om haar eigen status te verhogen. Andere middelen van onderzoek zijn monitors, forensisch onderzoek, het interviewen van vluchtelingen en rapportage. In onderzoek wordt ook veel gebruik gemaakt van berichten uit de media en van informatie van plaatselijke mensenrechtenverdedigers.
